Hola Mike, tu pregunta parece implicar que quizás estés utilizando el software incorrecto para desarrollar tu diseño. Parece que estás utilizando un software de modelado de superficies (como Blender) en lugar de un paquete CAD. Deberías probar software como Fusion 360 y Solidworks que pueden detectar una geometría deficiente con herramientas como validar modelo y comprobación sólida. La comprobación sólida es especialmente poderosa ya que puede detectar superficies inválidas/abiertas así como brechas de borde/superficie.